Der Oberschülerdetektiv Shin’ichi Kudo gilt als Meister seines Fachs. Mit seinen 17 Jahren ist er bereits ein Experte und hilft auch der Polizei bei ihren Fällen. Als jedoch Shin’ichi bei einem Date in einem Vergnügungspark zwei verdächtige Männer in schwarz bei einem Deal beobachtet, schleicht er ihnen nach, um die Sache aufzudecken. Jedoch bemerkt er den dritten Mann in schwarz hinter sich nicht, der ihn kurzerhand niederschlägt und vergiftet. Jedoch bewirkt das Gift nicht Shin’ichis Tod, sondern lässt ihn kleiner werden, so dass er die Größe eines Grundschülers annimmt. Um nicht aufzufallen, wohnt er ab sofort bei seiner Freundin Ran und ihrem Vater, der eine erfolglose Detektei führt. Unter seinem neuen Namen Conan Edogawa ermitteln er jedoch fleißig weiter, um eines Tages die Männer in schwarz auf die Spur zu kommen.
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